Historiquement, Lamanere existe depuis l'an 990. Il faisait alors parti de la vicomté de Castelnou et dépendait donc du Seigneur de Cabrenç dont le château se trouvait entre les villages de Lamanere et Serralongue.

L'église paroissiale, dédiée à Saint Sauveur, a été consacrée en 1378. L'édifice a subit de nombreuses modifications notamment au XVIIIe siècle.

Ce n'est qu'après la révolution que Lamanere devint un village indépendant, une commune.

Le sol du village étant riche en minerais, il y a eu aussi l'exploitation des mines. Elles auraient existé dès l'Antiquité. Il s'agissait de mines de fer, de cuivre et de plomb. Elles ont été exploitées jusqu'au début de XXe siècle.